Здравствуйте, Евгений! Ответ на ваш вопрос достаточно индивидуален. Есть несколько решений этой проблемы, но без ознакомления места конкретно дать совет не возможно. Пригласите специалиста на дом и он конкретно вам даст ответ.
Между дверью комнаты безопасности и каким полом 6 мм? Керамика? Если да, то снять керамику, выровнять поверхность до нужного уровня, если паркет цельный на всю квартиру и не удается после такой процедуры положить его без щелей в стыках у дверных проемов, то разделить коридор и комнаты металлическими планками. Согласен с Владимиром, пригласите специалиста, совет по интернету не всегда помогает.